Tháng 9/2009, Mourinho bị cấm chỉ đạo một trận và phải nộp phạt 20.000 đôla sau khi bị truất quyền chỉ đạo trong trận Inter gặp Cagliari tại Serie A. Trước đó ông tranh luận với trọng tài với yêu cầu phạt Davide Astori do phạm lỗi với Mario Balotelli (video).
Tháng 2/2010, Mourinho thể hiện điệu bộ như bị còng tay sau khi Walter Samuel và Ivan Cordoba nhận thẻ đỏ, còn Eto'o nhận thẻ vàng trong trận Inter gặp Sampdoria. HLV này cũng lớn tiếng chỉ trích trọng tài và kết quả là án cấm chỉ đạo ba trận và khoản phạt 55.000 đôla (video).
Tháng 11/2010, "Người đặc biệt" bị cấm chỉ đạo hai trận do xúc phạm trọng tài trong trận Real gặp Murcia tại Cup Nhà vua (video).
Tháng 12/2010, Mourinho tiếp tục nhận hai trận cấm chỉ đạo do yêu cầu hai học trò Sergio Ramos và Xabi Alonso tự nhận thẻ vàng trong trận gặp Ajax để nghỉ thi đấu lượt cuối vòng bảng Champions League, đồng thời "tẩy" sạch thẻ cho vòng đấu tiếp theo (video).
Tháng 5/2011, sau trận thua Barca tại bán kết Champions League, nhà cầm quân của Real bị phạt tới năm trận cấm chỉ đạo và 70.000 đôla do phát biểu "văng mạng", trong đó có câu "rõ ràng bây giờ chẳng đội nào có cơ hội thắng khi đá với Barca". Trong trận này bản thân ông bị truất quyền chỉ đạo còn Pepe nhận thẻ đỏ (video). Real sau đó hòa 1-1 ở lượt về và bị loại (video).
Tháng 4/2014, do phản đối trọng tài Chris Foy về quyết định truất quyền thi đấu của Ramires, Mourinho phải nộp 13.000 đôla và nhận lời cảnh cáo từ Ủy ban kỷ luật bóng đá Anh (video).
Tháng 5/2014, Mourinho phải nộp 16.000 đôla do mỉa mai trọng tài sau trận Chelsea thua Sunderland, thất bại đầu tiên của ông tại sân Stamford Bridge (video).
Tháng 1/2015, Mourinho phải nộp 38.000 đôla do phát biểu sau trận hòa Southampton rằng "đang có một chiến dịch chống lại Chelsea" (video).
Thùy Dương